瑞耘公司內部稽核單位直接隸屬於董事會，內部稽核人員秉持超然獨立之精神，以客觀公正立場確實執行其職務，除定期向審計委員會報告稽核業務外，並列席董事會報告。

稽核方式係依據年度稽核計畫執行例行性稽核，並另視需要執行專案稽核，以適時發現內控可能缺失，提供改善建議，並出具稽核報告，定期向審計委員會及董事會報告執行狀況，藉由評估及改善風險管理、控制及監理流程之有效性，協助董事會及管理階層達成既定目標。

此外，為確保內部控制制度得以持續有效實施，本公司每年度由各部門自行檢查其內部控制制度，再由內部稽核覆核其自行檢查報告，以協助董事會與管理階層檢查及複核內部控制制度之缺失，以適時提供改善建議，作為檢討修正內控制度之依據。